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bioxm(基因序列分析软件)

版本:v2.6 大小:3.52M 语言:简体中文 类别:其它行业
  • 类型:国产软件
  • 授权:免费软件
  • 更新:2023-08-15
  • 环境:Windows7,WinXP,WinVista
  • 本地下载
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情介绍

bioxm中文版是一款基于Windows的核酸序列分析开发的一款基因序列分析软件,由南京农业大学学生研究开发的。功能还是非常多的,主要用于常规分析DNA序列资料,包括ORF查找、序列格式化、翻译、限制酶酶切位点分析、引物辅助设计、两个序列Blast比较等,另外还提供了序列格式文件的批量转换工具,引物浓度计算工具,Tm计算,酶位点查询工具,自动去载体序列工具以及SCI影响因子查询等等。收藏夹中还收录了很多常用的基因或蛋白分析网址,包括了多序列比较和进化树分析,Bioxm中文版界面简洁,操作易上手,有需求的朋友可以下载。

中文版功能特色

1、酶切位点分析
输入序列之后,依次打开:序列分析>酶切位点分析,最后 点"开始分析"
2、DNA 统计分析
除了分析A、G、C、T、N的组成之外,还可以分析GC%的变化趋势。
3、序列比较
BioXM提供了两个序列比较的BLAST本地工具:
依次打开:序列分析>两个序列BLAST联配,依次选择序列比较的类型,输入序列后开始比较

常见问题

1、输入DNA序列BioXM似乎不能正确识别?
答: 这是因为BioXM默认打开的是氨基酸序列,您可以在菜单中选择“序列整理”命令。
2、序列窗口中的序列容易混淆,怎么办?
答: 鼠标双击序列窗口可以更改序列标签名,使您不会混淆各窗口。
3、每次输入DNA序列总是保留其他非法序列怎么办?
答: 您可以在选项中打开强制识别序列为DNA,这样就会祛除其他非法序列。但是如果您要打开氨基酸序列,必须关闭此项目。
4、如何才能快速了解新版本BioXM的特色?
答: 打开帮助>更新记录>可以使您快速了解新版本BioXM的特色。
5、我想编辑序列,该如何做?
答: 如果您要编辑序列或更改序列颜色,可以关闭工具栏中的“是否允许序列自动格式化”图标。
6、查找SSR时好象有所遗漏?
答: 其实这并不是BioXM的错误,考虑到相近的SSR有可能是相同的(至少非常相似),我们设置了两个重叠SSR之间的距离,将其设置的小一些可能会出现更多的彼此靠近的SSR。
7、我运行BioXM总是忘记了时间怎么办?
答: 不要紧,您可以在选项中打开“提醒打开BioXM时间”选项卡,这样每过1个小时,BioXM就会自动提醒您。
8、窗口数目太少,怎么办?
答: 在工具>选项>序列窗口>中可以更改窗口出现的数目和背景色。 

更新日志

v2.6版本
1、增加了2-4个序列窗口,序列分析更加方便
2、改进了界面,增加了新的图标
3、选项中增加了“序列”窗口选项卡,允许设置窗口数目及背景颜色等
4、修改了Blast程序的界面,更专业
5、酶切位点的位置增加了简单的图示
6、允许改变序列窗口的标签名
7、菜单中增加了“技巧和提示”
8、选项中增加菜单显示方式:XP或2003式样
9、选项中增加是否需要运行BioXM时间提示
10、工具中加入SSR搜索程序(v1.00),与其他程序相比,采用新的算法,对于超过100kb的序列搜索速度快
11、彻底改变文本框对于序列长度的限制
12、改进了序列快速格式化的算法,对于长序列速度显著加快
13、序列分析中加入蛋白质分子量和等电点计算

载地址

  • 电脑版
bioxm(基因序列分析软件) v2.6正式版

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